Prema najnovijem istraživanju američke međunarodne neprofitne organizacije Electronic Frontier Foundation (EFF), posvećene odbrani digitalnih prava, WhatsApp se nalazi u kategoriji najgorih kompanija za zaštitu prava i ličnih podataka na internetu.
Ovo je prvi put da je WhatsApp uključen u istraživanje, a ono je odmah pokazalo da je čuvena aplikacija prilično nesigurna. Od mogućih pet zvezdica, WhatsApp je dobio samo jednu. Naime, kompanija u vlasništvu Fejsbuka optužena je da podatke korisnika vrlo lako daje vlastima koje za to često nemaju nikakav nalog.
S druge strane, najsigurniji su Apple i Dropbox, koji su dobili pet zvezdica.